استنكر ديوان الوقف الشيعي في عدد من البيانات التي اصدرها الأعتداءات المتكررة على المراقد والجوامع والحسينيات في محافظة ديالى. اذ ادان الوقف الأعتداء الإرهابي على مرقد السيد عبد الله بن الأمام الكاظم (ع) وحسينية الكوثر في قرية زاغنية يوم السبت 17-2-2007. كما استنكر التفجير الذي طال جامع الخالص الكبير يوم الجمعة 29-12-2006. وفي بيان اخر استنكر ديوان الوقف الشيعي تفجير حسينية الأمام الصادق (ع) في قرية بازول بقضاء المقدادية يوم 12-2-2006، بعد ان قام الإرهابيون بقتل العشرات وتهجير 70 عائلة.